國庫集中支付是以國庫單一帳戶體系爲基礎，以健全的財政支付資訊系統和銀行間實時清算系統爲依託，支付款項時，由預算單位提出申請，經規定審覈機構（國庫集中支付執行機構或預算單位）審覈後，將資金透過單一帳戶體系支付給收款人的制度，那麼國庫集中支付制度是什麼？
1、實行國庫集中支付制度，首先要改革財政部門現行的機構設定和現行的財政覈算體系，建立國庫支付中心、會計覈算中心、政府採購部門有機結合的支付體系，確立預算審覈、資金支付、監督管理爲一體的預算機構設定和管理體制。
2、根據國庫集中支付制度的基本內容和國外經驗，應當建立單一帳戶和分類帳戶相結合的帳戶體系，實現集中資金、集中核算、集中支付。現階段我國應在堅持資金使用權和審批權不變的前提下，取消各預算單位原來的一切帳戶，由國庫集中支付中心在人民銀行開設“國庫單一帳戶”，將所有政府財政資金都存放於該帳戶，並在預算單位需要實際支付時，將資金從國庫單一帳戶直接撥付供應商。
3、在此之前，資金應該始終存放於國庫單一帳戶中。與此對應的是建立國庫分類賬冊管理體系，即在國庫單一帳戶下爲每個預算單位都設立支出總賬和分類賬，記錄它們各自的預算執行情況和資金使用情況。政府的財政預算部門每年給預算單位下達預算指標，並審批預算單位提出的用款申請，委託支付中心辦理具體的支付手續。
4、按照這種資金管理方式，政府財政資金支付都在國庫單一帳戶體系下統一進行，財政預算部門還要在商業銀行開設零餘額帳戶，併爲預算單位開設零餘額帳戶，透過零餘額帳戶，對政府財政資金採取財政直接支付和財政授權支付兩種方式支付到商品和勞務供應商。
5、財政直接支付制度是按照部門預算和用款計劃確定的資金用途和用款進度，根據用款單位申請，由財政部門將資金直接支付到商品、勞務供應者或用款單位。財政授權支付是根據部門預算和用款計劃確定的資金用途和用款進度，由預算單位自行開出支付令將資金支付到商品、勞務供應者或用款單位。商業銀行代理支付的財政資金，每日與財政部門開設在中國人民銀行的國庫單一帳戶進行清算。
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