測量部位不同：耳溫槍由於結構特點，更適用於測量耳道。而額溫槍就可以用於測量額頭、頸部以及手腕等身體表面任何部位。體溫準確度不同：耳溫槍與額溫槍相比較，耳溫槍的結果會更真實準確。由於鼓膜位於外耳道的最深處，不易受到外界溫度的影響，更能比較準確的反映體內的真實體溫。
額溫槍和耳溫槍相比，耳溫槍會更好。因爲額頭的溫度，容易受周圍環境以及風速影響，比方風大，額頭表面面板的溫度會降低。如果吹空調，在低溫空調的環境裏，可能體溫也會降低。但是耳溫是比較恆定的，因爲耳道相對是比較密閉的空間。溫度是相對恆定的，所以醫院裏一般常用的溫度計都是耳溫計，或者是腋下的溫度計。
當然，有些篩查的項目，可能會用額溫槍，因爲操作比較快，所以常規用於篩查項目，比方幼兒園的入園晨檢，或者是在大型場所的體溫監測，都是用額溫槍。
額溫槍的溫度比腋溫要偏低0.5-1℃，如果額溫槍測量將近37℃左右的時候，需要用腋溫計或者是耳溫計，進行進一步測量，看看有沒有體溫升高的情況。
