從種植技術上看，非轉基因大豆是經自然種植、生長得到的，轉基因大豆則使用了轉基因技術，在大豆中人工轉入了目標基因後種植得到的。外形上看。轉基因大豆的外觀形狀較規則，多爲正圓形，因爲成熟較快的原因，顏色較均勻，多爲淡黃色，非轉基因大豆形狀多爲橢圓形，顏色也要更深。和轉基因大豆相比，非轉基因大豆屬於純天然食物，沒有經過任何人工干預轉入基因，安全性相對也會更高一些。
看發芽縫，非轉基因大豆有明顯的發芽縫，俗稱“肚臍眼”。轉基因大豆也有發芽縫，但不明顯，因爲他的肚臍眼顏色跟豆身顏色基本一樣，所以沒有明顯的異色肚臍眼。
非轉基因大豆屬於營養價值很高的豆類食材，當中含有豐富的蛋白質、鈣、維生素和礦物質，也是蛋白質含量最多的糧類食材。轉基因大豆有經過外源基因的轉入，對大豆中含有的營養成分的破壞程度，目前還是個未知數。
非轉基因大豆油如何
非轉基因大豆油一般比較好。非轉基因大豆油是由非轉基因大豆生產的大豆油，一般非轉基因豆油對人體無害，因爲非轉基因豆油使用非轉基因大豆，非轉基因大豆油有很多好處。大豆油中含有大量亞油酸，亞油酸是人體必需的脂肪酸，具有重要的生理功能。非轉基因大豆油中還含有棕櫚酸7-10%,硬脂酸2-5%,花生酸1-3%,油酸22-30%,亞油酸50-60,亞麻油酸5-9%。
使用轉基因大豆油需要公示嗎
法律分析：正規商家生產的轉基因大豆油只需要在包裝上註明原料來源於“轉基因”大豆即可，不需要作其他公示。轉基因大豆油是國家允許的，合格的食用油，銷售購買都是合法的。 根據我國的轉基因食品強制標識的法律條文,轉基因大豆油不需要作標識。因爲法律明文規定,對於轉基因食品必須作強制標識。
