巫姓起源主要有四種說法，一是源自上古醫藥始祖，黃帝時期有一位宰相叫做巫彭，他非常精通醫術，被奉爲醫神，子孫就傳承了巫姓。二是源自魯國貴族叔肸，叔肸的曾孫叫做公巫召伯，他的子孫以祖先號爲姓。三是源自官職名，商朝設有官位叫做“巫咸”，子孫以祖先官爲姓。四是源於蒙古族，屬於漢化改姓爲氏。
巫姓在大陸沒有列入百家姓前一百位，在臺灣位列百家姓第八十五位。巫人的後代中有以官職爲姓氏的，稱爲巫氏，是今天巫姓的主要來源。商朝時，巫在朝廷中的地位相當高，大臣巫咸和他的兒子巫賢都是商朝的重要大臣，他們的後人稱爲巫氏。
