1、在完全控幹水分後直接將木耳放入冰箱上層冷藏儲存，保持五度左右的溫度。可儲存一天。2、將木耳控幹水分放入冷凍層儲存，則可以存放更長久的時間。在下次吃木耳以前，提前將木耳拿出來解凍。3、將發好的木耳從水中撈出來，然後放到瀝水架上面，將木耳放到通風並且乾燥的環境中等待木耳曬乾。
如何挑選木耳
1、眼看：凡朵大適度，耳瓣略展，朵面烏黑但無光澤，朵背略呈灰白色的爲上品；朵稍小或大小適度，耳瓣略卷，朵面黑但無光澤的屬中等；朵形小而碎，耳瓣卷而粗厚或有僵塊，朵灰色或褐色的最次。
2、手捏：通常優質的黑木耳含水量較少，取小量樣品，手捏易碎，放開後朵片能很好伸展，有彈性，說明含水量少，反之則過多。3、口嘗：純淨的黑木耳口感純正無異味，有清香氣，反之多爲變質或摻假品。常見摻假品用明礬水、鹼水浸泡或用食糖水拌勻，可用口嘗有無澀味、鹼味、甜味加鑑別。4、水泡：朵體質輕，水泡後脹發性大的屬優質；體稍重，吸水膨脹性一般的爲中等；體重，水泡脹發性差的爲劣質。
木耳一般要泡多久
涼水泡木耳一般用涼水浸泡3~4小時左右即可食用，如果想要達到最佳漲發率可以用15~25度的水泡上8個小時。木耳是一種菌類植物，新鮮木耳中含有大量水分，乾燥後變成革質，用涼水浸泡，可以讓木耳慢慢吸飽水，變成新鮮時的半透明狀態。這也是泡木耳效果最理想的方法。
如果使用淡鹽水泡木耳可以加快乾木耳的漲發速度，在淡鹽水中，木耳只需要1個小時即可，用鹽水泡洗木耳可以有效搓洗掉木耳中的沙子。
如果急着吃木耳而沒有提前泡木耳，熱水泡木耳是一種應急的方式。熱水泡木耳一般需要15~20分鐘左右，但是熱水泡出的木耳漲發率低，而且口感綿軟不脆爽。
